Sīki

Aukstā genoma secība


No visām izplatītajām veselības problēmām, iespējams, neviena nav tik pazīstama kā saaukstēšanās. Augšējo elpceļu iekaisums ir vīrusu izcelsmes, taču, tā kā ir daudz dažādu rinovīrusu, ir ierasts, ka katru reizi, kad jauns izraisa infekciju.
Pret saaukstēšanos nav vakcīnas, un ārstēšana nodarbojas tikai ar simptomu novēršanu - piemēram, iesnas un klepu, sāpēm muskuļos, galvu un rīkli un savārgumu -, ko neizraisa vīrusi, bet gan ķermeņa reakcija uz iebrukumu. Rinovīrusa infekcija ir atbildīga par pusi no astmas lēkmēm un ir galvenais faktors bronhīta, sinusīta, ausu infekciju un pneimonijas gadījumos.

Pētnieki Amerikas Savienotajās Valstīs tikko spēruši lielu soli uz izpratnes palielināšanu par svarīgo problēmu.

Žurnāla Science vietnē publicētajā rakstā grupa apraksta visu 99 zināmo vīrusu celmu, kas izraisa saaukstēšanos, genomiskās secības.

Secības tika sakārtotas sava veida ciltskokā, kas parāda, kā vīrusi ir savstarpēji saistīti, to līdzības un atšķirības. Autori norāda, ka darbs nodrošina jaudīgu rīku, kas varētu izraisīt pirmo efektīvo saaukstēšanās ārstēšanas līdzekļu izstrādi.
"Līdz šim mums nav izdevies izstrādāt efektīvas zāles, lai izārstētu parasto saaukstēšanos, kas varētu būt saistīts ar informācijas trūkumu par visu celmu ģenētisko uzbūvi," sacīja Stefans Liggets, Medicīnas skolas profesors un programmas direktors. Merilendas Universitātes kardiopulmonālās genomikas katedra, galvenā pētījuma autore.

“Par saaukstēšanos parasti domājam kā par vienkāršu neērtību, taču maziem bērniem vai veciem cilvēkiem tie var būt novājinoši. Viņi var izraisīt astmas lēkmes arī jebkurā vecumā. Turklāt jaunākie pētījumi norāda, ka rinovīrusu infekcijas maziem bērniem var ieprogrammēt viņu imūnsistēmu pusaudža gados attīstīt astmu, ”sacīja Liggett.
Zinātnieki ir noskaidrojuši, ka cilvēka rinovīrusi ir sadalīti 15 mazās grupās, kuras mantotas no tāliem senčiem. Šo vairāku grupu atklājums izskaidro, kāpēc pieeja “viens saaukstēšanās līdzeklis” nedarbojas.
Viņi arī novēroja, ka vīrusi izlaiž soli olbaltumvielu ražošanā - saīsni, kas, iespējams, palielina mikroorganismu ātrumu, lai cilvēks drīzāk sajustu simptomus pēc inficēšanās.

“Šī ir jauna atziņa, kas nebūtu iespējama, ja tā netiktu atklāta, izmantojot genomu analīzi.

Informācija, kas iegūta no šī atklājuma, var pārstāvēt pilnīgi atšķirīgu pieeju terapijai, ”sacīja Klēra Freizere-Liggeta, Merilendas Universitātes Genomikas zinātņu institūta direktore, cita pētījuma autore.

Pētījumā tika norādīts, ka daži no cilvēka rinovīrusiem rodas ģenētiskā materiāla apmaiņas rezultātā starp diviem atšķirīgiem vīrusa celmiem, kas inficē vienu un to pašu indivīdu. Tika uzskatīts, ka šāda rekombinācija nav iespējama cilvēku rinovīrusos. Aukstākos mēnešos, kad daudzi vīrusa celmi izraisa infekcijas, rekombinācija var ātri radīt jaunus celmus.
Vairākas mutācijas (apmēram 800) bija acīmredzamas vīrusu paraugos, ko pētnieki ieguva no pacientiem ar saaukstēšanos, salīdzinot ar vecākiem rinovīrusa atsauces celmiem. Daži vīrusi modificējas, veicot nelielas izmaiņas noteiktos proteīnos, lai novērstu to iznīcināšanu ar cilvēka imūnsistēmas antivielām. "Mutācijas ir atrastas katrā genoma apgabalā," sacīja Klēra.
“Uzkrātie dati no šīm pilnīgajām genomu sekvencēm dod mums iespēju pārskatīt saaukstēšanās vakcīnas kā iespēju, it īpaši tāpēc, ka mēs apkopojam paraugus no daudziem pacientiem un secīgus veselus genomus, lai redzētu, cik bieži viņi piedzīvo mutācijas aukstākos mēnešos. ”Sacīja Stefans Ligets. Šis tagad publicētā pētījuma turpinājums jau notiek.
Rakstā Visu zināmo cilvēka rinovīrusu genomu sekvencēšana un analīze atklāj Stefana Liggeta un citu veidoto struktūru un evolūciju, to var lasīt Science abonenti vietnē (//www.sciencemag.org)

Pielāgots no: Agência Fapesp - Zinātniskā izplatīšana - 02/13/09

Saistītais saturs:

Vīrusi

Video: Modular Data Center Supports Ground Breaking Genome Research Analytics. Schneider Electric (Septembris 2020).